以往小三通旅運大樓通關動線之修繕,為避免影響正常通關都要利用夜間施工,常常礙於時間及場地因素,要半半施工且品質不佳,此次受新冠肺炎疫情影響,金廈小三通自109年2月10日宣佈停航,本處趁停航期間著手進行水頭旅客服務中心出入境通關動線及周邊設施修繕作業,本次已完成出境查驗區域通關動線油漆粉刷補強修繕作業及出入境包樑木作裝潢汰換作業,期待疫情結束復航之後,讓旅客有煥然一新之感受,進而提昇國家形象提昇小三通之服務水準與品質。